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Un descubrimiento casual ha generado un nuevo método para encontrar virus desconocidos. (Foto: Universidad de Oxford)

Detectan virus desconocido a través de estudios del ADN de salmón

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Friday, August 11, 2017, 23:50 (GMT + 9)

Un grupo de científicos del Departamento de Zoología de la Universidad de Oxford encontró en los genomas de 15 especies diferentes de peces, entre los que se encuentran el salmón del Atlántico y la trucha arco iris, rastros de un nuevo grupo de virus, relacionado con el herpes virus.

Los investigadores desarrollaron algoritmos que detectan el ADN de los virus que se encuentran en una muestra de sangre o tejido de las especies estudiadas. Si bien su investigación se centró en los genomas de peces, señalan que el método podría ser utilizado para identificar los virus en una gama de diferentes especies.

En el marco de sus estudios, el grupo descubrió que la secuenciación de próxima generación y sus bases de datos online de ADN asociadas podrían utilizarse en el campo del descubrimiento viral.

La secuenciación de próxima generación  permite a los científicos reunir grandes cantidades de datos a partir de una sola pieza de ADN, que luego se agrupan en enormes bases de datos online del genoma, que son accesibles para el público general.

El Dr. Aris Katzourakis, profesor asociado, y el Dr. Amr Aswad, investigador asociado del Departamento de Zoología de Oxford, descubrieron el nuevo uso de la base de datos por casualidad. Mientras buscaban un antiguo virus herpes en los primates, encontraron evidencia de dos nuevos virus que no habían sido documentados.                  

Estimulados por su descubrimiento accidental, los científicos quisieron ver si podían obtener el mismo resultado de manera intencional. Con este fin, comenzaron a desarrollar un proyecto separado para encontrar nuevos virus de herpes que infectan a los peces, y utilizaron la técnica para examinar más de 50 genomas de peces en busca de un ADN viral reconocible.

           

Para confirmar que la evidencia viral no era simplemente una casualidad, o un error de procesamiento de datos, analizaron muestras adicionales tomadas en un supermercado local y un restaurante de sushi. Y encontraron los mismos fragmentos virales en las muestras compradas.

La clave del éxito de esta investigación radica en su enfoque interdisciplinario, que combina técnicas de dos campos: la biología evolutiva y la genómica. Juntas, estas técnicas son el  centro del nuevo campo de la paleovirología. Esta disciplina es el estudio de virus antiguos que han integrado su ADN en el de sus huéspedes, a veces hace millones de años. Cada técnica utilizada se ha desarrollado para analizar grandes cantidades de datos de secuencia de ADN.

"Una de las fortalezas reales de esta técnica, en comparación con los enfoques virológicos más tradicionales, es la velocidad del descubrimiento, y la no dependencia en la identificación de un individuo enfermo. Los datos virales recolectados, que de otro modo podrían haberse descartarse como una molestia, son un recurso único para la búsqueda de virus patógenos y benignos que de otro modo habrían quedado sin descubrir", recalcó el Dr. Katzourakis.

El equipo planea comenzar a investigar el impacto de los virus y si tienen alguna implicación a largo plazo para las enfermedades o la piscicultura comercial.

Los resultados del estudio fueron publicados en la revista científica Virus Evolution.

 
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www.fis.com

 


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